Detalhe da pesquisa
1.
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges.
Nat Methods;
19(4): 429-440, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35396482
2.
Scalable sequence database search using partitioned aggregated Bloom comb trees.
Bioinformatics;
39(39 Suppl 1): i252-i259, 2023 06 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37387170
3.
Locality-preserving minimal perfect hashing of k-mers.
Bioinformatics;
39(Suppl 1): i534-i543, 2023 06 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37387137
4.
BLight: efficient exact associative structure for k-mers.
Bioinformatics;
37(18): 2858-2865, 2021 09 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33821954
5.
Toward perfect reads: self-correction of short reads via mapping on de Bruijn graphs.
Bioinformatics;
36(5): 1374-1381, 2020 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30785192
6.
Compacting de Bruijn graphs from sequencing data quickly and in low memory.
Bioinformatics;
32(12): i201-i208, 2016 06 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27307618
7.
Read mapping on de Bruijn graphs.
BMC Bioinformatics;
17(1): 237, 2016 Jun 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27306641
8.
Toward perfect reads: self-correction of short reads via mapping on de Bruijn graphs.
Bioinformatics;
36(2): 651, 2020 01 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31808510
9.
Scalable long read self-correction and assembly polishing with multiple sequence alignment.
Sci Rep;
11(1): 761, 2021 01 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33436980
10.
STRONG: metagenomics strain resolution on assembly graphs.
Genome Biol;
22(1): 214, 2021 07 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34311761
11.
Chromosome-level genome assembly reveals homologous chromosomes and recombination in asexual rotifer Adineta vaga.
Sci Adv;
7(41): eabg4216, 2021 Oct 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34613768
12.
ELECTOR: evaluator for long reads correction methods.
NAR Genom Bioinform;
2(1): lqz015, 2020 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33575566
13.
On the representation of de Bruijn graphs.
J Comput Biol;
22(5): 336-52, 2015 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25629448